La Parrocchia risale al XV secolo e fa parte della Diocesi di Milano. Fin dal XIII secolo la chiesa fu alle dipendenze della Pieve di Varenna, all’inizio del XIV secolo passò sotto la responsabilità della Pieve di Perledo per poi distaccarsi intorno al XV secolo, risultando costituita nel 1455.
Nel XIX e XX secolo la parrocchia di Esino fu inclusa nella pieve e nel vicariato foraneo di Perledo; nel 1971 venne attribuita al decanato dell’Alto Lario nella zona pastorale III di Lecco.
Nel 1552 fu istituita canonicamente la Confraternita del Santissimo Sacramento e nel 1662 la Confraternita del Sacro Rosario: le due furono unite dall’’arcivescovo Benedetto Erba Odescalchi nel 1722.